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scientific-computational-materials

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scientific-materials-characterization

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scientific-publication-figures 論文品質（Nature/Science/Cell レベル）の科学図表を作成するスキル。matplotlib rcParams 設定、 DPI 300、spines 制御、カ…

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scientific-academic-writing

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scientific-advanced-visualization 科学データ高度可視化スキル。Plotly インタラクティブ 3D ・ Altair 宣言的可視化・Seaborn 統計プロット・ アニメーション…

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scientific-cancer-genomics

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scientific-cellxgene-census CELLxGENE Census 大規模シングルセルアトラススキル。 CZ CELLxGENE Census API によるヒト/マウス全アトラスの メタデータ…

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scientific-cheminformatics ケモインフォマティクス解析のスキル。RDKit を用いた分子記述子計算、Morgan フィンガープリント、 Tanimoto 類似度、構造ア…

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scientific-data-preprocessing 科学データの前処理パイプラインスキル。欠損値補完（KNNImputer/SimpleImputer）、 エンコーディング（LabelEncoder/OneHot/…

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scientific-data-profiling データプロファイリング・品質スキル。ydata-profiling 自動 EDA ・ Great Expectations データバリデーション・データ品質ス…

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scientific-deep-research

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scientific-eda-correlation 探索的データ解析（EDA）と相関分析のスキル。データの分布可視化、相関ヒートマップ、 散布図行列の作成を行う際に使用。Sci…

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scientific-geospatial-analysis 地理空間データ解析スキル。GeoPandas ベクターデータ処理・ Rasterio ラスター解析・Folium/Kepler.gl インタラクティブ地図…

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scientific-human-protein-atlas Human Protein Atlas (HPA) 統合スキル。組織/細胞タンパク質発現、 がん予後バイオマーカー、RNA 発現プロファイル、細胞内…

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scientific-immunoinformatics

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scientific-lab-data-management ラボデータ管理スキル。Benchling (ELN/DNA 設計/レジストリ)、 DNAnexus (ゲノミクス PaaS)、LatchBio (ワークフロー)、 OME…

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scientific-meta-analysis メタ解析スキル。固定効果・ランダム効果モデル（DerSimonian-Laird）、Forest プロット、 異質性評価（I²/Q 検定/τ²）、出版…

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scientific-pipeline-scaffold

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scientific-protein-design タンパク質設計スキル。ESM タンパク質言語モデル、de novo 設計、指向性進化の 計算的ガイド、安定性予測をカバー。ToolUniv…

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scientific-proteomics-mass-spectrometry

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scientific-radiology-ai 放射線診断支援 AI スキル。CADe/CADx パイプライン・ CT/MRI 分類・セグメンテーション・Grad-CAM 説明可能性・ 構造化レポ…

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scientific-rcsb-pdb-search RCSB PDB 構造検索スキル。RCSB PDB Search API および Data API によるタンパク質立体構造検索・メタデータ取得・ リガンド…

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scientific-reinforcement-learning 強化学習スキル。Stable-Baselines3 による RL エージェント訓練、 Gymnasium 環境構築、PufferLib 大規模マルチエージェント…

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scientific-reproducible-reporting 再現可能レポーティングスキル。Quarto 科学文書・ Jupyter Book 多章構成・Papermill パラメトリック実行・ nbconvert 自動…

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scientific-revision-tracker

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scientific-spectral-signal 分光スペクトルおよび生体信号の前処理・解析スキル。ベースライン補正、フィルタリング、 ピーク検出、帯域パワー解析を行う…

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scientific-statistical-testing 統計検定・多重比較・エンリッチメント解析のスキル。t検定、カイ二乗検定、ANOVA、 Bonferroni/BH 補正、Fisher 正確検定、…

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scientific-structural-proteomics 構造プロテオミクス統合スキル。EMDB クライオ EM、PDBe 構造データ、 Proteins API (UniProt)、Complex Portal 複合体、Deep…

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scientific-systematic-review PRISMA 2020 準拠系統的レビュースキル。マルチ DB 検索戦略立案 (PubMed/Embase/Cochrane/Web of Science)、スクリーニング…

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